Sun decidió lanzar NetBeans con licencia doble:

CDDL y GPLv2 with Classpath Exception

De ésta forma, NetBeans se hace más amigable para Linux, y se mantiene consistente con el JDK bajo GPL2 y el proyecto GlassFish>

El agregado "Classpath exception" permite enlazar una aplicación bajo cualquier licencia, a una librería que es parte de software con GPLv2, sin estar sujeta a los requerimientos de la GPL de ser ofrecida al público bajo la GPL.
A partir de NetBeans 6.0, se podrá obtener este IDE bajo GPLv2 con Classpath Exception, y CDDL.